getRatioMatrix calculates the ratio matrix of phosphoproteome data
from a MultiAssayExperiment object.
Value
A numeric matrix representing the ratio of intensity of PP
(phosphoproteome) data to FP (full proteome) data.
Examples
# Load multiAssayExperiment object
data("dia_example")
# Call the function
getRatioMatrix(dia_example, normalization = TRUE)
#> Phospho_1stCrtl_0min_rep2 Phospho_1stCrtl_0min_rep3
#> s13 NA NA
#> s16 -3.7643939 NA
#> s36 NA NA
#> s37 NA NA
#> s40 NA NA
#> s57 -4.3233417 -3.3027041
#> s58 -4.3233417 -3.3027041
#> s59 -4.3233417 -3.3027041
#> s60 -4.9211318 -1.8669683
#> s64 NA NA
#> s65 NA -3.1975354
#> s79 NA NA
#> s83 NA NA
#> s93 NA NA
#> s94 2.2532894 NA
#> s114 NA NA
#> s128 NA NA
#> s129 NA NA
#> s136 NA NA
#> s142 NA NA
#> s144 NA NA
#> s145 NA 8.8920740
#> s147 NA NA
#> s150 -1.5001613 NA
#> s151 NA NA
#> s153 -1.7884873 NA
#> s154 NA NA
#> s155 -0.2206020 NA
#> s158 NA NA
#> s162 NA NA
#> s167 NA -1.6745031
#> s173 -1.9308668 1.6516496
#> s174 -4.3686259 NA
#> s176 NA NA
#> s177 NA NA
#> s179 NA NA
#> s180 NA NA
#> s181 NA NA
#> s188 NA -1.2480599
#> s197 NA NA
#> s198 NA NA
#> s199 NA NA
#> s212 NA 0.1952259
#> s219 NA NA
#> s220 NA NA
#> s221 NA NA
#> s234 NA NA
#> s237 NA NA
#> s240 NA NA
#> s244 NA NA
#> s246 NA NA
#> s265 3.5204058 NA
#> s270 -8.2796228 -7.0913119
#> s271 -8.2796228 -7.0913119
#> s274 -6.9236588 -8.3827098
#> s278 NA NA
#> s283 NA -6.3197134
#> s287 NA NA
#> s299 NA -3.2379105
#> s302 NA NA
#> s304 NA NA
#> s307 NA -3.0786511
#> s311 NA -10.0262252
#> s313 NA NA
#> s322 NA NA
#> s325 NA NA
#> s330 NA NA
#> s341 NA NA
#> s347 NA NA
#> s348 NA NA
#> s356 -1.5070661 NA
#> s362 0.3978409 -0.1927442
#> s374 NA NA
#> s376 -0.3729111 -1.1199006
#> s377 -7.2027484 NA
#> s381 -3.7637242 -3.8044981
#> s382 NA NA
#> s393 0.2304416 -0.4156391
#> s395 NA NA
#> s396 NA 3.6908447
#> s401 NA NA
#> s416 NA NA
#> s418 NA NA
#> s430 NA NA
#> s436 -7.0904517 NA
#> s444 -2.1876346 NA
#> s448 NA -9.7025047
#> s451 NA -4.0506228
#> s452 NA 1.0338960
#> s454 NA NA
#> s457 NA NA
#> s470 NA -2.7403064
#> s472 NA NA
#> s474 0.5698129 -0.0758101
#> s482 NA NA
#> s488 NA NA
#> s499 NA NA
#> s500 1.3884624 0.7454984
#> Phospho_1stCrtl_100min_rep2 Phospho_1stCrtl_100min_rep3
#> s13 NA NA
#> s16 NA NA
#> s36 NA NA
#> s37 NA NA
#> s40 2.414032293 3.59138064
#> s57 -3.446662944 -2.51928708
#> s58 -3.446662944 -2.51928708
#> s59 -3.446662944 -2.51928708
#> s60 -3.446662944 -1.45078302
#> s64 NA NA
#> s65 NA NA
#> s79 NA -1.41597841
#> s83 NA NA
#> s93 NA NA
#> s94 NA NA
#> s114 NA NA
#> s128 NA -9.78903466
#> s129 NA -9.78903466
#> s136 NA NA
#> s142 NA NA
#> s144 NA NA
#> s145 -4.533103313 -1.12185247
#> s147 NA NA
#> s150 NA NA
#> s151 NA NA
#> s153 NA NA
#> s154 -2.489925626 NA
#> s155 NA 0.48252290
#> s158 NA -2.03910048
#> s162 NA NA
#> s167 NA -4.54359072
#> s173 -2.531618195 -2.10220759
#> s174 NA NA
#> s176 NA NA
#> s177 NA NA
#> s179 NA NA
#> s180 NA NA
#> s181 -4.343526443 NA
#> s188 -1.095991743 NA
#> s197 NA NA
#> s198 2.212898838 NA
#> s199 NA NA
#> s212 1.483997733 0.26346771
#> s219 NA NA
#> s220 NA NA
#> s221 NA 0.09330300
#> s234 NA 9.54959755
#> s237 NA NA
#> s240 3.882016582 NA
#> s244 NA -2.94990304
#> s246 NA NA
#> s265 NA NA
#> s270 -10.341975085 -9.79108232
#> s271 -10.341975085 -9.79108232
#> s274 -8.936996355 -8.43425891
#> s278 NA NA
#> s283 NA NA
#> s287 NA NA
#> s299 -3.730188485 -5.25817801
#> s302 NA NA
#> s304 NA NA
#> s307 -4.430467039 -2.22740000
#> s311 NA NA
#> s313 NA NA
#> s322 3.157243008 NA
#> s325 NA NA
#> s330 NA NA
#> s341 NA NA
#> s347 NA NA
#> s348 NA NA
#> s356 NA NA
#> s362 0.004915533 0.07296485
#> s374 NA NA
#> s376 -0.943445996 -1.47253029
#> s377 NA NA
#> s381 -2.567132319 -3.24466915
#> s382 NA NA
#> s393 0.001857241 -0.15719872
#> s395 NA NA
#> s396 NA 3.14368385
#> s401 NA NA
#> s416 NA NA
#> s418 NA NA
#> s430 NA NA
#> s436 -7.254007291 NA
#> s444 NA NA
#> s448 NA NA
#> s451 NA NA
#> s452 NA -0.74753146
#> s454 NA NA
#> s457 NA NA
#> s470 0.010617871 NA
#> s472 NA NA
#> s474 1.716430997 0.46489341
#> s482 -3.728395761 -0.36131445
#> s488 NA NA
#> s499 NA 2.40259179
#> s500 0.748722186 0.83472183
#> Phospho_EGF_10min_rep2 Phospho_EGF_10min_rep3 Phospho_EGF_100min_rep2
#> s13 -7.025506174 NA NA
#> s16 -5.556174953 NA -3.8222037
#> s36 NA NA NA
#> s37 NA 0.8709432 NA
#> s40 NA NA 2.5930917
#> s57 -2.634147566 -4.5640618 -2.2585646
#> s58 -2.634147566 -4.5640618 -2.2585646
#> s59 -2.634147566 -4.5640618 -2.2585646
#> s60 -2.634147566 -5.2063405 -2.2585646
#> s64 1.631715360 NA NA
#> s65 -0.006010127 NA NA
#> s79 NA NA NA
#> s83 4.083505008 NA NA
#> s93 NA NA NA
#> s94 NA NA NA
#> s114 -5.960754232 NA NA
#> s128 NA NA NA
#> s129 NA NA NA
#> s136 NA NA NA
#> s142 -6.895033509 NA NA
#> s144 NA NA NA
#> s145 NA NA -2.2053733
#> s147 NA 4.7138385 NA
#> s150 -0.088360496 NA -1.7554356
#> s151 NA NA -1.7371280
#> s153 NA NA NA
#> s154 -0.030058853 NA NA
#> s155 NA NA -0.8632875
#> s158 NA NA -4.4545300
#> s162 1.558051503 4.9800398 NA
#> s167 NA NA NA
#> s173 -2.715464977 0.9857779 -2.9365945
#> s174 NA NA NA
#> s176 NA -6.4248242 -10.1680540
#> s177 NA -6.4248242 -8.7199236
#> s179 NA -1.3044115 NA
#> s180 NA NA NA
#> s181 NA NA NA
#> s188 -1.088815486 -0.6549753 NA
#> s197 -5.282908049 NA NA
#> s198 NA NA NA
#> s199 NA NA NA
#> s212 0.264601131 0.3043399 0.4239538
#> s219 0.653740249 NA NA
#> s220 4.296131588 NA NA
#> s221 NA NA 0.5698976
#> s234 10.101989461 NA 0.2201499
#> s237 NA NA NA
#> s240 NA NA NA
#> s244 NA NA NA
#> s246 NA NA NA
#> s265 NA NA NA
#> s270 NA -10.5271969 NA
#> s271 NA -10.5271969 NA
#> s274 -8.275496761 -7.8471385 -7.6725834
#> s278 -2.264472152 NA -3.7080424
#> s283 NA NA NA
#> s287 -0.737231627 NA -1.2037960
#> s299 -1.745238954 -3.6697727 -5.2699696
#> s302 NA -0.9554264 NA
#> s304 NA NA NA
#> s307 -3.248705393 -3.3531115 -3.8507753
#> s311 NA NA NA
#> s313 NA NA NA
#> s322 1.644023592 -1.9626936 NA
#> s325 NA NA 0.8947103
#> s330 NA NA NA
#> s341 NA NA -5.0873552
#> s347 -0.637347404 NA NA
#> s348 NA NA NA
#> s356 NA NA NA
#> s362 -0.837153924 NA -0.1999119
#> s374 NA NA NA
#> s376 -0.986094449 -2.0678469 -1.2613732
#> s377 NA NA -0.7666310
#> s381 -4.407529659 -4.3554403 -5.0762369
#> s382 NA NA NA
#> s393 -0.414638314 -0.2392067 -0.2934095
#> s395 NA NA NA
#> s396 2.835465953 NA NA
#> s401 NA NA NA
#> s416 NA NA NA
#> s418 NA NA -0.2748643
#> s430 -2.220519607 NA NA
#> s436 -7.509013050 -7.1500188 NA
#> s444 NA NA NA
#> s448 NA NA NA
#> s451 -6.090285030 -6.4500009 NA
#> s452 NA NA NA
#> s454 NA NA NA
#> s457 NA NA NA
#> s470 NA -3.4419921 NA
#> s472 NA NA NA
#> s474 0.095250177 0.3781762 0.1442772
#> s482 NA -1.6690894 -1.2880232
#> s488 NA NA -7.9628736
#> s499 NA NA NA
#> s500 0.149844819 0.7993372 0.3023715
#> Phospho_EGF_100min_rep3 Phospho_HGF_10min_rep2 Phospho_HGF_10min_rep3
#> s13 NA NA NA
#> s16 NA -3.94015233 NA
#> s36 NA 2.15897383 NA
#> s37 NA NA NA
#> s40 NA 2.44515585 NA
#> s57 -4.18897750 -4.10933733 -2.9207293
#> s58 -4.18897750 -4.10933733 -2.9207293
#> s59 -4.18897750 -4.10933733 -2.9207293
#> s60 -4.18897750 -4.91682017 -2.9207293
#> s64 NA NA 1.0668834
#> s65 NA NA NA
#> s79 NA NA NA
#> s83 NA NA NA
#> s93 -2.28322345 NA NA
#> s94 NA NA NA
#> s114 NA NA NA
#> s128 NA NA NA
#> s129 NA NA NA
#> s136 14.31235974 NA NA
#> s142 NA -5.41535671 NA
#> s144 NA NA NA
#> s145 NA NA NA
#> s147 NA NA NA
#> s150 NA NA NA
#> s151 -3.14211361 NA NA
#> s153 -1.78585633 NA NA
#> s154 NA 1.29184206 NA
#> s155 NA NA NA
#> s158 -3.50322539 NA NA
#> s162 NA NA NA
#> s167 -3.99095421 6.62157929 NA
#> s173 -1.35581798 -1.11159628 1.7085950
#> s174 NA NA NA
#> s176 NA NA NA
#> s177 NA NA NA
#> s179 NA NA NA
#> s180 NA NA NA
#> s181 NA NA NA
#> s188 -0.92222013 NA -0.4928061
#> s197 NA -5.05887765 NA
#> s198 NA NA NA
#> s199 NA -1.09900797 NA
#> s212 NA 0.57234627 0.6497259
#> s219 NA NA NA
#> s220 NA NA NA
#> s221 NA NA NA
#> s234 NA NA NA
#> s237 NA NA 1.7622516
#> s240 NA NA NA
#> s244 NA -3.26628311 NA
#> s246 NA NA NA
#> s265 0.07735383 NA NA
#> s270 -10.14583417 -7.27460097 -9.8822933
#> s271 -10.14583417 -7.27460097 -9.8822933
#> s274 -7.67927731 -8.12701776 -7.6784462
#> s278 NA NA NA
#> s283 NA NA NA
#> s287 NA NA NA
#> s299 -4.76153981 -5.31066046 -2.5101768
#> s302 NA NA NA
#> s304 1.11599956 NA NA
#> s307 NA NA NA
#> s311 NA NA NA
#> s313 NA NA NA
#> s322 -2.51800318 -1.99753838 NA
#> s325 NA NA NA
#> s330 NA 3.55241926 2.2394399
#> s341 NA NA NA
#> s347 NA NA NA
#> s348 NA 3.24974688 NA
#> s356 NA NA NA
#> s362 -0.18130222 -0.08825152 0.4569485
#> s374 NA NA NA
#> s376 -2.34717624 1.89361401 -0.4842351
#> s377 NA NA -3.0284911
#> s381 -4.63558862 -4.86594529 -4.2492993
#> s382 NA NA NA
#> s393 -0.46275198 0.21203169 -0.1676951
#> s395 -3.69051651 NA NA
#> s396 2.94197556 2.87511952 2.7616507
#> s401 NA NA NA
#> s416 NA NA NA
#> s418 NA NA NA
#> s430 NA NA NA
#> s436 NA -7.54740416 NA
#> s444 NA NA NA
#> s448 NA NA NA
#> s451 NA NA NA
#> s452 NA NA NA
#> s454 0.64227255 NA NA
#> s457 NA NA 0.5700706
#> s470 NA NA -0.9069880
#> s472 6.47432216 NA NA
#> s474 -0.25805015 1.05040336 0.3613268
#> s482 NA NA NA
#> s488 NA NA NA
#> s499 NA NA NA
#> s500 -1.06057119 0.56263283 NA
#> Phospho_HGF_100min_rep2 Phospho_HGF_100min_rep3 Phospho_1stCrtl_0min_rep1
#> s13 NA -6.0252423 NA
#> s16 NA NA NA
#> s36 NA NA NA
#> s37 NA NA NA
#> s40 NA NA NA
#> s57 -1.68874750 -1.1364318 -2.68632848
#> s58 -1.68874750 -1.1364318 -2.68632848
#> s59 -1.68874750 -1.1364318 -2.68632848
#> s60 -2.48774011 -1.1364318 -2.68632848
#> s64 NA NA NA
#> s65 NA NA NA
#> s79 NA NA NA
#> s83 NA NA NA
#> s93 NA NA NA
#> s94 NA NA NA
#> s114 NA NA NA
#> s128 NA NA NA
#> s129 NA NA NA
#> s136 NA NA NA
#> s142 NA NA NA
#> s144 2.36849245 NA NA
#> s145 NA NA NA
#> s147 NA 0.4245685 NA
#> s150 NA NA NA
#> s151 NA NA -1.77563524
#> s153 NA NA NA
#> s154 NA NA NA
#> s155 NA NA NA
#> s158 NA NA NA
#> s162 NA 3.2412030 NA
#> s167 NA NA NA
#> s173 -0.73211692 -2.3106651 -1.67778572
#> s174 NA NA NA
#> s176 -5.79107561 NA NA
#> s177 -5.79107561 NA NA
#> s179 NA NA NA
#> s180 NA -3.0472205 NA
#> s181 NA NA NA
#> s188 -0.83201254 -0.3813293 0.82120229
#> s197 NA NA NA
#> s198 NA NA NA
#> s199 NA NA NA
#> s212 0.63430078 0.9853540 NA
#> s219 2.08969581 NA NA
#> s220 NA NA NA
#> s221 1.04459780 NA NA
#> s234 NA NA 11.37116345
#> s237 NA NA 3.11567330
#> s240 NA NA NA
#> s244 NA NA NA
#> s246 NA NA NA
#> s265 NA NA NA
#> s270 NA NA NA
#> s271 NA NA NA
#> s274 -7.59422976 NA NA
#> s278 -4.10492801 NA NA
#> s283 NA NA NA
#> s287 NA NA NA
#> s299 -5.72084076 NA -2.76913358
#> s302 NA NA NA
#> s304 NA NA NA
#> s307 NA -3.9611183 2.12882906
#> s311 NA NA NA
#> s313 NA -4.3989730 NA
#> s322 NA NA NA
#> s325 NA NA NA
#> s330 NA NA NA
#> s341 NA NA NA
#> s347 NA NA NA
#> s348 NA NA NA
#> s356 NA NA NA
#> s362 0.34632966 0.6241446 0.09162791
#> s374 13.81234052 NA NA
#> s376 -1.19834382 -0.7339090 NA
#> s377 NA NA NA
#> s381 -4.57087062 -3.7681520 -0.39839266
#> s382 -1.96234183 NA NA
#> s393 -0.03704081 -0.1992859 -0.98039387
#> s395 -2.61268104 NA NA
#> s396 NA NA NA
#> s401 NA 5.0001281 NA
#> s416 NA NA NA
#> s418 0.95099717 NA NA
#> s430 NA NA NA
#> s436 -7.51870156 NA -5.39444488
#> s444 NA NA NA
#> s448 NA NA -6.68121086
#> s451 NA NA NA
#> s452 NA 0.1777189 NA
#> s454 NA NA NA
#> s457 NA NA NA
#> s470 -0.30910237 NA NA
#> s472 NA NA NA
#> s474 0.25704761 0.6816826 -0.54158350
#> s482 NA NA NA
#> s488 -8.21496276 NA NA
#> s499 NA NA NA
#> s500 1.25784743 1.2933145 1.51811754
#> Phospho_1stCrtl_100min_rep1 Phospho_EGF_10min_rep1 Phospho_EGF_24h_rep1
#> s13 NA NA -10.07403491
#> s16 NA NA NA
#> s36 NA NA NA
#> s37 NA NA 10.80789513
#> s40 NA NA NA
#> s57 3.19752774 -1.28417467 -0.10970776
#> s58 3.19752774 -1.28417467 -0.10970776
#> s59 3.19752774 -1.28417467 -0.10970776
#> s60 3.19752774 -1.28417467 -0.10970776
#> s64 NA NA NA
#> s65 NA NA NA
#> s79 NA NA NA
#> s83 NA NA NA
#> s93 NA NA NA
#> s94 NA NA NA
#> s114 NA NA NA
#> s128 NA NA NA
#> s129 NA NA NA
#> s136 NA NA NA
#> s142 NA NA NA
#> s144 NA NA NA
#> s145 NA NA NA
#> s147 NA NA NA
#> s150 NA NA NA
#> s151 NA NA NA
#> s153 NA NA NA
#> s154 NA NA NA
#> s155 NA NA NA
#> s158 NA NA NA
#> s162 NA NA NA
#> s167 NA NA NA
#> s173 NA -0.02529155 NA
#> s174 NA NA NA
#> s176 NA -2.98461811 NA
#> s177 NA -2.98461811 NA
#> s179 NA NA NA
#> s180 NA NA NA
#> s181 NA NA NA
#> s188 NA NA 0.04104979
#> s197 NA NA NA
#> s198 NA NA NA
#> s199 NA NA NA
#> s212 NA NA NA
#> s219 NA NA NA
#> s220 NA NA NA
#> s221 NA NA NA
#> s234 NA NA NA
#> s237 NA NA NA
#> s240 NA NA NA
#> s244 NA NA NA
#> s246 -0.35240174 NA -3.03112463
#> s265 NA NA NA
#> s270 -6.66483810 -6.43261730 -5.97381227
#> s271 -6.66483810 -6.43261730 -5.97381227
#> s274 NA NA NA
#> s278 NA NA NA
#> s283 NA NA NA
#> s287 NA NA NA
#> s299 -3.68356880 NA -3.98612399
#> s302 NA NA NA
#> s304 NA NA NA
#> s307 NA NA NA
#> s311 NA NA NA
#> s313 NA NA -0.99066429
#> s322 NA NA NA
#> s325 NA NA NA
#> s330 NA NA NA
#> s341 NA NA NA
#> s347 NA NA NA
#> s348 NA NA NA
#> s356 NA NA NA
#> s362 NA NA 0.95245543
#> s374 NA NA NA
#> s376 NA NA NA
#> s377 NA NA NA
#> s381 0.03161015 -1.03772016 NA
#> s382 NA NA NA
#> s393 -1.58066105 -2.35553973 -2.23757754
#> s395 NA NA NA
#> s396 NA NA NA
#> s401 NA NA NA
#> s416 NA -6.05459464 NA
#> s418 NA NA NA
#> s430 NA NA NA
#> s436 -5.94319031 NA NA
#> s444 NA NA NA
#> s448 -6.98898512 -6.96448577 -7.83055829
#> s451 NA NA NA
#> s452 NA NA NA
#> s454 NA NA NA
#> s457 NA NA NA
#> s470 NA NA NA
#> s472 NA NA NA
#> s474 1.92784628 -0.90649324 1.19740090
#> s482 NA NA 8.69336266
#> s488 NA NA -0.84858875
#> s499 NA NA NA
#> s500 NA NA NA
#> Phospho_EGF_100min_rep1 Phospho_HGF_10min_rep1 Phospho_HGF_24h_rep1
#> s13 NA -4.089779 NA
#> s16 NA NA NA
#> s36 NA NA NA
#> s37 NA NA NA
#> s40 NA NA NA
#> s57 NA -1.603229 NA
#> s58 NA -1.603229 NA
#> s59 NA -1.603229 NA
#> s60 NA -1.603229 NA
#> s64 NA NA NA
#> s65 NA NA NA
#> s79 NA NA NA
#> s83 NA NA NA
#> s93 NA NA NA
#> s94 NA NA NA
#> s114 NA NA NA
#> s128 NA NA NA
#> s129 NA NA NA
#> s136 NA NA NA
#> s142 NA NA NA
#> s144 NA NA NA
#> s145 NA NA NA
#> s147 NA NA NA
#> s150 NA NA NA
#> s151 NA NA NA
#> s153 NA NA NA
#> s154 NA NA NA
#> s155 NA NA NA
#> s158 NA NA NA
#> s162 NA NA NA
#> s167 NA NA NA
#> s173 NA NA NA
#> s174 NA NA NA
#> s176 NA NA NA
#> s177 NA NA NA
#> s179 NA NA NA
#> s180 NA NA NA
#> s181 NA NA NA
#> s188 NA NA NA
#> s197 NA -5.310601 NA
#> s198 NA NA NA
#> s199 NA NA NA
#> s212 NA NA NA
#> s219 NA NA NA
#> s220 NA NA NA
#> s221 NA NA NA
#> s234 NA NA NA
#> s237 NA NA NA
#> s240 NA NA NA
#> s244 NA NA NA
#> s246 NA NA NA
#> s265 NA NA NA
#> s270 -7.9953481 -5.295009 NA
#> s271 -7.9953481 -5.295009 NA
#> s274 NA NA -6.2659013
#> s278 NA NA NA
#> s283 NA NA NA
#> s287 NA NA NA
#> s299 -4.0211310 -3.260359 -2.5015333
#> s302 NA NA NA
#> s304 NA NA NA
#> s307 NA NA NA
#> s311 NA NA NA
#> s313 NA -2.469246 NA
#> s322 NA NA NA
#> s325 NA NA NA
#> s330 NA NA NA
#> s341 NA NA NA
#> s347 NA NA NA
#> s348 NA NA NA
#> s356 NA NA NA
#> s362 NA NA NA
#> s374 NA NA NA
#> s376 NA NA NA
#> s377 NA NA NA
#> s381 NA -1.616862 -1.1535401
#> s382 NA NA NA
#> s393 -1.0621359 -2.535146 -1.3683106
#> s395 NA NA NA
#> s396 NA NA NA
#> s401 NA NA NA
#> s416 -9.3688472 NA NA
#> s418 NA NA NA
#> s430 NA NA NA
#> s436 NA -7.051126 NA
#> s444 NA NA NA
#> s448 -8.5337133 -8.162944 NA
#> s451 NA NA NA
#> s452 2.9492475 NA NA
#> s454 NA NA NA
#> s457 NA NA NA
#> s470 NA NA -0.8770891
#> s472 NA NA NA
#> s474 0.3295746 0.388710 0.5693116
#> s482 NA NA NA
#> s488 NA NA NA
#> s499 NA NA NA
#> s500 NA NA NA
#> Phospho_HGF_100min_rep1
#> s13 -3.744997
#> s16 NA
#> s36 NA
#> s37 NA
#> s40 NA
#> s57 NA
#> s58 NA
#> s59 NA
#> s60 NA
#> s64 NA
#> s65 NA
#> s79 NA
#> s83 NA
#> s93 NA
#> s94 NA
#> s114 NA
#> s128 NA
#> s129 NA
#> s136 NA
#> s142 NA
#> s144 NA
#> s145 NA
#> s147 NA
#> s150 NA
#> s151 NA
#> s153 NA
#> s154 NA
#> s155 NA
#> s158 NA
#> s162 NA
#> s167 NA
#> s173 NA
#> s174 NA
#> s176 NA
#> s177 NA
#> s179 NA
#> s180 NA
#> s181 NA
#> s188 NA
#> s197 NA
#> s198 NA
#> s199 NA
#> s212 NA
#> s219 NA
#> s220 NA
#> s221 NA
#> s234 NA
#> s237 NA
#> s240 NA
#> s244 NA
#> s246 NA
#> s265 NA
#> s270 -11.388234
#> s271 -11.388234
#> s274 NA
#> s278 NA
#> s283 NA
#> s287 NA
#> s299 -1.938292
#> s302 NA
#> s304 NA
#> s307 NA
#> s311 NA
#> s313 NA
#> s322 NA
#> s325 NA
#> s330 NA
#> s341 NA
#> s347 NA
#> s348 NA
#> s356 NA
#> s362 NA
#> s374 NA
#> s376 NA
#> s377 NA
#> s381 NA
#> s382 NA
#> s393 -1.916995
#> s395 NA
#> s396 NA
#> s401 NA
#> s416 NA
#> s418 NA
#> s430 NA
#> s436 -7.965392
#> s444 NA
#> s448 -9.416012
#> s451 NA
#> s452 NA
#> s454 NA
#> s457 NA
#> s470 NA
#> s472 NA
#> s474 -2.251489
#> s482 NA
#> s488 NA
#> s499 NA
#> s500 NA